本會前身為花蓮漁業生產組合,成立於民國二十年(即日據時代昭和六年),於民國三十五年七月正式核准成立花蓮縣漁會,至民國四十四年七月劃分為花蓮、新城兩個區漁會,民國五十年十一月新城區漁會又劃入本會轄區,迄今轄區涵蓋本縣行政區域-北起秀林鄉和平村,南至豐濱鄉靜浦村,會員分佈於秀林、花蓮、吉安、豐濱等沿海鎮市。
花蓮縣位於台灣地區之東部,北接宜蘭縣、南鄰台東縣、西與中央山脈為界、東臨太平洋,海岸線北起秀林鄉和平村,南至豐濱鄉靜埔村,全長達136公里。就漁業而言,沿岸及近海皆屬太平洋黑潮主流經過之範圍,海域廣闊,底質多為岩礁,各種洄游性及底棲魚類資源豐富。 因海岸濱臨太平洋,海底坡度陡峭,山勢高聳,較少灣澳,目前僅有花蓮、石梯、鹽寮三處漁港及十三處小型漁筏停靠據點。
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